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The study of endangered species is crucial to their survival, and this can be done through monitoring that helps targeting conservation needs. Indirect monitoring methods make it possible to study animals that are difficult to observe. Traces of presence, such as footprints, contain a wide range of information about their author that can be used to characterise an individual. On the one hand, the objective of this study is to identify individuals, their sexes and weights based on 3D models of cheetah tracks including the study of these factors over time. On the other hand, the objective is to determine a new measurement technique for cheetah trails. Eight semi-captive Namibian cheetahs were studied. Geometric morphometrics highlighted shape differences through the use of 25 fixed landmarks and 130 surface sliders. The tracks were discriminated by performing a Linear Discriminant Analysis (LDA) with jack-knife prediction using size and conformation information from a Principal Component Analysis (PCA). Regarding footprint position, the best prediction effectively identifies 95.19% of the footprints. Individuals were correctly identified in 82.9% of the prints, sex in 87.9% of the prints and weight in 87.6% of the prints. The analysis of male prints increased the accuracy of weight identification to 100% for the best case studied. The comparison of direct measurements and digital measurements (with a drone and with a camera) of cheetah trails showed that each technique was equivalent and could substitute the other. Differences in male and female gait characteristics from overstep trails were statistically significant. L'étude d'espèces en voie d'extinction est cruciale pour leur survie et cela passe par le monitoring qui permet de cibler les besoins en termes de conservation. Les méthodes de monitoring indirectes permettent d'étudier des animaux difficilement observables. Les traces de présence, comme les empreintes contiennent une large gamme d'informations à propos de leur auteur qui peuvent être exploitées pour caractériser des individus. D'une part, l'objectif de cette étude est d'identifier les individus, leurs sexes et leurs poids basés sur des modèles 3D de traces de guépards en incluant l'étude de ces facteurs dans le temps. D'autre part, l'objectif est de déterminer une nouvelle technique de mesure pour les démarches de guépards. Huit guépards Namibiens semi-captifs ont été étudiés. La morphométrie géométrique a mis en évidence les différences de conformation des traces grâce à l'utilisation de 25 points de repère fixes et de 130 de pseudo points de repères. Les traces ont été discriminées par la réalisation d'une Analyse Linéaire Discriminante (ALD) avec prédiction jack-knife en utilisant des informations de taille et de conformation issues d'une Analyse en Composantes Principales (ACP). Concernant la position de l'empreinte, la meilleure prédiction identifie efficacement 95.19% des empreintes. L'identification des individus est correcte pour 82.9% des empreintes, celle des sexes pour 87.9% des empreintes et celle du poids pour 87.6% des empreintes. L'analyse des empreintes des mâles a permis d'augmenter la précision de l'identification du poids jusqu'à un taux de 100% pour le meilleur cas étudié. La comparaison des mesures directes et mesures digitales (avec un drone et avec une caméra) des démarches de guépards a démontré que chaque technique était équivalente et pouvait suppléer une autre. Les différences entre démarches (à vitesse similaire) de mâles et de femeles, se sont avérées significatives statistiquement.
Acinonyx jubatus --- cheetah --- 3D modelling --- Track --- Trail --- Wildlife monitoring --- footprint --- geometric morphometrics --- photogrammetry --- indirect monitoring --- Sciences du vivant > Zoologie
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Wildlife monitoring is a crucial part of the conservation strategies for endangered species. Indirect methods are of significant interest because they preserve the studied animal. The study of presence signs, especially footprints, seems to be a valuable compromise between reliability, simplicity and feasibility. The main objective of this study is to develop an algorithm capable of identifying cheetahs based on their tracks. It also aims to recognize their sex and from which foot the track originated (i.e. position). In addition, it seeks to compare different track recording medium: photo and 3D model. We sampled 669 tracks of eight semi-captive cheetahs, corresponding to about 20 tracks per foot. We manually placed 25 fixed landmarks per track and 130 semilandmarks on 3D models only. Geometric morphometrics allowed studying the differences in shape between tracks. Thanks to a Linear Discriminant Analysis (LDA) with a jackknife prediction, the tracks were discriminated using the information from both their size and shape. We tested 82 combinations in terms of medium, landmarks configuration and template used. For position identifications, the best combination correctly identified 98.2% of the tracks. The sex and identity of the cheetahs are identified with an accuracy of 94.8% and 93.7% respectively. These tools appear to be effective in separating positions, sexes and individual identities from the tracks. A field study using tracks from wild individual should be conducted to further confirm the true efficiency of this technique. Le monitoring de la faune sauvage est une partie cruciale des stratégies de conservation des espèces en danger d’extinction. Les méthodes indirectes sont d’un intérêt particulier car elles permettent de préserver l’animal étudié. L’étude des indices de présence, plus particulièrement des empreintes, semble être un compromis de qualité entre fiabilité, simplicité et faisabilité. Cette étude a pour objectif principal de créer un algorithme capable d’identifier des guépards sur base de leurs empreintes. Elle vise aussi la reconnaissance de leur sexe et de quelle patte est issue l’empreinte (i.e. la position). De même, elle cherche aussi de comparer différent support d’enregistrement de l’empreinte : photo et modèle 3D. Nous avons échantillonné les empreintes de 8 guépards semi-captif, correspondant à environ 20 empreintes par pied. Nous avons placé manuellement 25 points de repère fixes par empreintes et 130 pseudo points de repères uniquement sur les modèles 3D. La morphométrie géométrique a permis d’étudier les différences de conformation entres les empreintes. Grâce à une Analyse Linéaire Discriminante (ADL) avec des prédictions jackknife, les empreintes ont pu être discriminées en utilisant les informations issues de leurs tailles et de leurs conformations. Nous avons testé 82 en terme de support, configuration de point de repère et de modèle utilisé. Pour l’identification des positions, la meilleure combinaison identifie correctement 98.2% des empreintes. Le sexe et l’identité des guépards sont retrouvés avec une précision de 94.8% et 93.7% respectivement. Ces outils se montrent efficaces pour séparer les positions, les sexes et les identités des individus grâce aux empreintes. Une étude sur le terrain utilisant des empreintes d’individu sauvage doit être effectuée pour confirmer l’efficacité de cette technique.
cheetah --- Acinonyx jubatus --- track --- footprint --- wildlife monitoring --- indirect monitoring --- non-invasive --- 3D model --- photogrammetry --- guépard --- Acinonyx jubatus --- empreinte --- monitoring de la faune sauvage --- monitoring indirect --- non-invasif --- modèle 3D --- photogrammétrie --- Sciences du vivant > Sciences de l'environnement & écologie
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