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Telomeres are ribonucleoproteic structures which protect chromosome ends from exonucleolytic degradation and inter-chromosomic fusions. In somatic cells, telomere length decreases with each cell division, thereby limiting their proliferation potential. In most cancer cell lines, telomere length is maintained by a ribonucleoprotein complex called telomerase, allowing cells to proliferate indefinitely (TEL+ cells). However, some telomerase-deficient cancer cell lines use an alternative mechanism of telomere maintenance (ALT cells). This mechanism, based on homologous recombination between telomeric repeats, is characterized by high rates of telomeric sister chromatid exchanges (T-SCE) but remains poorly understood.
Methylation is the only known epigenetic modification of DNA. In mammals, DNA is methylated on CpG dinucleotides, mainly located within repetitive sequences (pericentromeric and subtelomeric regions), as well as in some gene promoters. Recent studies have shown that mouse stem cells lacking DNA methyltransferase exhibit a reduced level of subtelomeric DNA methylation, heterogeneous telomere lengths and higher rates of T-SCE. Similar observations have been made in mouse cells lacking telomerase, suggesting the existence of a link between subtelomeric DNA methylation level and telomere dynamics.
To investigate the possible impact of subtelomeric DNA methylation level on the rate of T-SCE in human cell lines, we analysed subtelomeric DNA methylation levels in ALT and TEL+ cancer cell lines. We detected a lower methylation level in ALT cells, but this subtelomeric DNA hypomethylation was not observed in ALT fibroblasts derived from in vitro immortalization with SV40T. This suggests that subtelomeric DNA hypomethylation is not required for ALT mechanism.
Next, we started to investigate the impact of telomerase on subtelomeric DNA methylation in human cancer cell lines. To this end, we analysed subtelomeric methylation levels: 1) in ALT cells transfected with the telomerase catalytic subunit-encoding gene (hTERT); 2) in TEL+ cells, with low subtelomeric DNA methylation, overexpressing hTERT; and 3) in cellular hybrids between ALT and TEL+ cells. We also checked if subtelomeric DNA remethylation could be observed in TEL+ cancer cells that had been treated with a DNA demethylating agent Les télomères sont des structures nucléoprotéiques chargées de protéger l’extrémité des chromosomes des dégradations exonucléasiques et des fusions inter-chromosomiques. Dans les cellules somatiques, les télomères s’érodent au fil des divisions cellulaires, limitant ainsi leur potentiel de prolifération. Dans la majorité des lignées cancéreuses, la longueur de leurs télomères est maintenue grâce à un complexe ribonucléoprotéique appelé télomérase, ce qui leur permet de proliférer indéfiniment (lignées TEL+). Cependant, certaines lignées cancéreuses dépourvues de télomérase utilisent un mécanisme alternatif de maintien des télomères (cellules ALT). Ce mécanisme, basé sur des recombinaisons homologues, est caractérisé par des taux élevés d’échanges entre chromatides sœurs au niveau des télomères (T-SCE) mais reste encore mal compris.
La méthylation est la seule modification épigénétique de l’ADN connue. Chez les mammifères, l’ADN est méthylé au niveau de dinucléotides CpG, principalement situés dans des séquences répétitives (régions péricentromérique et subtélomérique) et dans les promoteurs de certains gènes. De récentes études ont montré que des cellules souches de souris déficientes en DNA méthyltransférase présentent une diminution de la méthylation de l’ADN subtélomérique, des longueurs de télomères hétérogènes et des taux accrus de T-SCE. Des observations similaires ont été faites dans des cellules murines déficientes en télomérase, ce qui suggère qu’il existe un lien entre le niveau de méthylation de l’ADN subtélomérique et la dynamique des télomères.
Afin de tester l’impact éventuel du niveau de méthylation de l’ADN subtélomérique sur le taux de T-SCE dans des lignées humaines, nous avons analysé le niveau de méthylation subtélomérique dans des lignées cancéreuses humaines ALT et TEL+. Nous avons détecté un niveau de méthylation plus bas dans les cellules ALT, mais cette hypométhylation subtélomérique ne s’est pas observée dans des lignées de fibroblastes ALT issus de l’immortalisation in vitro par SV40T. Ceci suggère qu’une hypométhylation de l’ADN subtélomérique n’est pas requise pour le mécanisme ALT.
Nous avons ensuite entamé l’étude de l’influence de la télomérase sur la méthylation de l’ADN subtélomérique dans des lignées cancéreuses humaines. Pour cela, nous avons analysé le niveau de méthylation subtélomérique : 1) dans des lignées ALT transfectées avec le gène encodant la sous-unité catalytique de la télomérase (hTERT) ; 2) dans des hybrides cellulaires entre cellules cancéreuses ALT et TEL+; et 3) dans des cellules TEL+ dont l’ADN subtélomérique est faiblement méthylé, surexprimant hTERT. Nous avons également vérifié si une reméthylation de l’ADN subtélomérique pouvait avoir lieu dans des cellules cancéreuses TEL+ ayant subi un traitement par agent déméthylant
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Telomerase --- Telomere --- Congresses. --- Congresses.
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Aging. --- Cartilage. --- Osteoarthritis. --- Telomere.
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The telomeres are protected by a looped structure which is mediated by a protein complex called shelterin. In actively dividing cells, replication of telomeres requires the establishment of specialized compensatory systems to prevent their shortening. In the absence of compensation, telomeres shorten with each cell division until reaching the Hayflick limit, which is characterized by an arrest of cell division and entry into replicative senescence. In the early stages of embryonic development and in stem or germ cells, telomerase helps maintaining telomere length by synthesizing TTAGGG repeats through its reverse transcriptase activity. In other normal cells, telomerase expression is repressed. Unlike the vast majority of normal cells, cancer cells are characterized by unlimited proliferation and the reactivation of a telomere maintenance mechanism during the process of tumorigenesis. While reactivation of telomerase is the mechanism mostly found, 10-15 % of tumors implement an alternative lengthening of telomeres. These cells, called ALT , rely on homologous recombination events to lengthen shortened telomeres. The ALT phenotype is characterized by a great heterogeneity of telomere length due to the presence of extra-chromosomal telomeric DNA, specialized PML bodies called "ALT associated PML bodies" and telomeric variant sequences which bind orphan nuclear receptors. The establishment of ALT probably depends on the specific loss of homologous recombination inhibitors at the telomere, since this latter mechanism is suppressed in normal and cancer cells using telomerase. Recently, several studies have correlated the ALT phenotype with the Joss of expression of a histone chaperone called ATRX. ATRX is therefore a first candidate repressor of ALT. However, experimental inactivation by RNA silencing of this protein is not sufficient to activate ALT.The objective of this mémoire was to gain a better understanding of the molecular mechanisms of activation of ALT using comparative analyzes of cell lines using either ALT or telomerase. To this end, new cell lines of similar genetic background were generated through the technique of cell hybrids. The work in Master 1 has allowed us to identify two hybrids that appeared to have the ALT phenotype. Further analyzes were performed during Master 2 using in quantitative and qualitative techniques such as FISH, Western blot and activity measurement telomerase, to highlight the activation of ALT. These hybrids provide a basis for the identification of causative mutations.In addition to hybrids, we also initiated the study of tumors which display a high indience of ALT, such as sarcoma. The cell cultures were provided by a collaboration with the clinicat hospital of St-Luc. The analysis of these primary cultures should provide valuable information on the changes resulting in activation of ALT in vivo. Une structure en boucle. médiée par un complexe protéique appelé shelterin, permet la protection des extrémités chromosomiques, les télomères. Dans les cellules en division, la réplication des télomères requiert la mise en place de systèmes compensatoires spécialisés pour éviter leur raccourcissement. En l'absence de compensation, les télomères se raccourcissent à chaque division cellulaire jusqu'à atteindre la limite de Hayflick, caractérisée par un arrêt de division cellulaire et l'entrée en sénéscence réplicative. Lors des premiers stades du développement embryonnaire et dans les cellules souches ou germinales, la télomérase permet le maintien de la longueur des télomères en synthétisant les répétitions TTAGGG grâce à son activité de transcriptase inverse. Dans les autres cellules normales, l'expression de la télomérase est réprimée. A l'inverse de la grande majorité des cellules normales, les cellules cancéreuses se distinguent par une prolifération illimitée qu'elles doivent à la réactivation d'un mode de maintien des télomères au cours du processus de tumorigenèse. Deux mécanismes distincts de maintien des télomères ont été découverts dans les tumeurs. Alors que la réactivation de la télomérase est le mécanisme majoritairemen t retrouvé, 10-15% des tumeurs mettent en place un mécanisme alternatif d'allongement des télomères. Ces cellules, dites ALT, font appel à des phénomènes de recombinaison homologue pour allonger les télomères raccourcis.Le phénotype ALT se caractérise par une grande hétérogénéité de longueur des télomères, par la présence d'ADN télomérique extra-chromosomique, de corps PML spécialisés appelés « ALT-associated PML bodies » et de variants de séquences télomériques sur lesquels se fixent des récepteurs nucléaires dont la fonction aux télomères est toujours inconnue. La mise en place du mécanisme ALT dépend probablement de la perte spécifique d'inhibiteurs de recombinaison homologue au niveau du télomère puisque cette dernière est réprimée dans les cellules normales et dans les cellules cancéreuses faisant appel à la télomérase. Récemment, plusieurs études ont corrélé le phénotype ALT avec la perte d'expression d'une chaperone d'histone appelée ATRX. ATRX représente dès lors un premier candidat répresseur de ALT. Toutefois, l'inactivation expérimentale de l'expresssion d'ATRX par RNA silencing n'est pas suffisante pour activer ALT. L'objectif de ce mémoire était d'acquérir une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires de l'activation de ALT à l'aide d'analyses comparatives de lignées cellulaires faisant appel soit à ALT soit à la télomérase . A cette fin, de nouvelles lignées cellulaires de background génétique semblable ont été générées grâce à la technique des hybrides cellulaires. Le travail effectué en Master l nous a permis de déceler 3 hybrides qui semblaient présenter le phénotype ALT. De plus amples analyses ont été effectuées au cours du travail de Master 2 à l'aide de techniques permettant de mettre en évidence les différents phénotypes de ALT de manière quantitative et qualitative telles que le FISH, le Western Blot et la mesure d'activité de la télomérase. Ces hybrides serviront de base à l'identification future de mutations causatives. En plus des hybrides, nous avons également initié l'étude de tumeurs présentant fréquemment le phénotype ALT, telles que celles provenant de sarcomes, et qui nous sont fournies par une collaboration avec les cliniques St-Luc. L'analyse de ces cultures primaires devrait apporter des informations précieuses sur les mutations à l'origine de l'activation de ALT in vivo.
Hybrid Cells --- Neoplasms --- Phenotype --- Telomere Homeostasis --- Telomere Shortening
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Telomere. --- Telomere. --- Chromosomes --- Cytogenetics. --- Aging --- Neoplasms --- Genetics. --- Genetics. --- Pathogenesis.
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ADP-ribosylation --- Chromatin --- Epigenesis --- Telomere
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melanoma-specific antigens --- telomere --- Cell Aging --- Neoplasms
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Biochemists --- Telomere --- History. --- Blackburn, Elizabeth H.
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Telomerase --- Uterine Cervical Neoplasms --- Telomere --- biosynthesis --- diagnosis --- genetics --- metabolism
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