Abstract | Keywords | Export | Availability | Bookmark

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Snelle en accurate identificatie van micro-organismen is in vele toepassingsdomeinen een vereiste. De conventionele methoden kunnen hier niet steeds aan voldoen en zijn vaak tijdrovend, arbeidsintensief of vereisen ervaren microbiologen. Een alternatief voor deze conventionele methoden is matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS). Hoewel deze techniek nog maar recent werd geïntroduceerd op microbiologisch werkterrein, is ze in enkele jaren uitgegroeid tot een snelle, nauwkeurige en rendabele methode. In deze studie wordt geëvalueerd of deze techniek ook geschikt is voor het analyseren van complexe microbiële gemeenschappen. Hiervoor werden mengsels van bacteriële reinculturen met MALDI-TOF MS geanalyseerd die tot 21 verschillende species bevatten. De aandachtspunten waren: het effect van stijgende microbiële complexiteit van een mengsel op de kwaliteit en bruikbaarheid van de massaspectra, de mogelijkheid om verschillende mengsels van elkaar te onderscheiden en de gevoeligheid van de techniek. Daarnaast kon door celoplossingen van reinculturen met verschillende celdensiteiten te analyseren, ook de detectielimiet van de techniek nagegaan worden. Naarmate het aantal species in een mengsel verhoogd, zal de complexiteit van het massaspectrum toenemen. Bij stijging van de complexiteit zal het MALDI-TOF MS profiel nauwelijks aan kwaliteit moeten inboeten. Hierdoor blijft het potentieel bestaan om alle mengsels van elkaar te onderscheiden, hoewel dit niet steeds mogelijk was met de software die in deze studie ter beschikking was. De gevoeligheid van MALDI-TOF MS hangt af van de gebruikte stam. Maar met een minimum van 106 cellen is het meestal mogelijk om een kwaliteitsvol profiel te genereren. Deze resultaten geven een eerste indicatie van de toekomstmogelijkheden die MALDI-TOF MS kan bieden als snelle en betrouwbare techniek voor de analyse van complexe microbiële gemeenschappen.

H363-sociolinguïstiek. --- H490-spaanse-taal-en-letterkunde. --- Identificatie. --- MALDI-TOF MS. --- Mengsels van reinculturen. --- SHIME-reactor. --- T490-biotechnologie.