Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Im Mittelpunkt dieser Arbeit standen Untersuchungen an nackten Aluminiumclustern (Aln-) in der Gasphase. Unter Verwendung der kommerziellen Ionspec-MALDI-Ionenquelle stand mit der Laser-Desorption/Ionisation (LDI) von Lithiumaluminiumhydrid (LiAlH4) eine zuverlässige Methode zur Erzeugung von Aln-Clusteranionen zur Verfügung.

FT-ICR --- Reaktivität --- MALDI-MS --- Gasphase --- Elektrospray-Ionisation --- Massenspektrometrie

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Le pontage chimique (chemical crosslinking) est une technique visant à lier de
façon covalente certains sites réactifs d’une protéine (ou d’un complexe protéique)
spatialement proche. Après une réaction de pontage, l’échantillon est digéré puis est
analysé par HPLC-MS/MS, mais à l’heure actuelle seul le résultat final est analysé. Il
n’existe pas de méthode facile pour optimiser et suivre la réaction de la protéine avec
l’agent de pontage. Durant ce mémoire, une méthode de suivis rapide et facile par
MALDI-MS a été développée pour suivre les réactions de pontage au cours du temps
sous différente condition expérimentale. Pour s’assurer de l’efficacité de la méthode,
trois protéines modèles ont été sélectionnées pour couvrir une large gamme de
masse : le cytochrome c (12 kDa) la BSA (66 kDa) et la phosphorylase b (97 kDa).
Chacune de ces protéines a été pontée par deux réactifs de pontage : le BS3 et l’ADH
couplé au DMTMM. Les résultats montrent que notre méthodologie MALDI-MS
permet de suivre les réactions au cours du temps pour ces trois protéines. De plus, la
plupart des résultats obtenus sont reproductibles et permettent de comprendre
rapidement le comportement d’une protéine avec un agent de pontage. Par
conséquent, il est aisé de sélectionner des conditions expérimentales et préparer une
protéine avec un nombre de pontages désiré. Cette méthodologie est capable de
jouer un rôle non négligeable dans l’étude de la réactivité des protéines avec les
agents de pontage, mais aussi de créer le lien entre nombre de pontage par protéine
et les informations structurales obtenues après HPLC-MS/MS.

MALDI --- Crosslink --- Protein --- Physique, chimie, mathématiques & sciences de la terre > Chimie

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

This eBook is a collection of articles from a Frontiers Research Topic. Frontiers Research Topics are very popular trademarks of the Frontiers Journals Series: they are collections of at least ten articles, all centered on a particular subject. With their unique mix of varied contributions from Original Research to Review Articles, Frontiers Research Topics unify the most influential researchers, the latest key findings and historical advances in a hot research area! Find out more on how to host your own Frontiers Research Topic or contribute to one as an author by contacting the Frontiers Editorial Office: frontiersin.org/about/contact

Science: general issues --- Medical microbiology & virology --- Microbiology (non-medical) --- mass spectometry --- MALDI-TOF --- susceptibility testing --- carbapenamase --- resistance detection --- MRSA - Methicillin-resistant Staphylococcus aureus --- mass spectometry --- MALDI-TOF --- susceptibility testing --- carbapenamase --- resistance detection --- MRSA - Methicillin-resistant Staphylococcus aureus

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Laser desorption/ionization (LDI) mass spectrometry on porous silicon (MS) is a promising alternative to matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) MS for the study of small molecules. Indeed, LDI-MS employs nanostructured porous silicon surfaces instead of organic matrices to assist the analyte desorption/ionization, which greatly limits the interference generated in the low m/z range, and thus allows the analysis of low molecular weight compounds. In addition, the use of porous silicon surface has the potential to provide other valuable advantages, such as the dual-polarity capabilities of the substrate, the compatibility with multimodal experiments and the possibility to functionalize the surface to improve the selectivity or the limit of detection of the technique. However, the use of porous silicon surfaces in real applications first requires a good understanding of the different aspects of the LDI-MS technique, including for example the impact of the nanosubstrate morphology on the desorption/ionization process harshness (analytes fragmentation). The objective of this Master’s thesis is to gain a better understanding of the desorption/ionization process occurring on porous silicon surfaces to ultimately optimize them for the LDI-MS analysis of small molecules such as metabolites or organic pollutants.

Mass spectrometry --- MS --- SALDI-MS --- MALDI-MS --- LDI --- Porous silicon --- Effective Temperature --- Physique, chimie, mathématiques & sciences de la terre > Chimie

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Bij de moeilijk te identificeren bacteriën, zoals nonfermenters en mycobacteria, dienden alternatieve targetgenen gesequeneerd te worden om meer informatie te verschaffen betreffende de species status van de onbekende isolaat. Het recA gen en gyrB gen werden om deze reden onderzocht voor identificatie van het Burkholderia cepacia complex, Acinetobacter spp. en mycobacteria. Na analyse blijkt het recA gen in staat te zijn om een verbeterde identificatie tot op species niveau te geven bij leden van het Burkholderia cepacia complex. Een ultieme identi ficatieprocedure tot op species niveau voor alle kiemen, enkel en alleen op basis van sequencing van één of meerdere targetgenen, is nog niet mogelijk. Bijkomende alternatieve methodes zijn hierbij noodzakelijk.Als geen identificatie kan worden verkregen d.m.v. MALDI-TOF MS kan sequencing van het 16S rRNA worden aanzien als de eerste stap waarbij in de meeste gevallen een identificatie tot op species niveau kan worden verkregen. Als dit echter niet het geval is, kan sequencing van alternatieve targetgenen worden uitgevoerd om een verbeterde identificatie te verkrijgen tot op species niveau. Correcte identificatie van klinische bacteriële isolaten is belangrijk voor het opstarten van de geschikte behandeling en eventuele controlemaatregelen. Vooral bij immuunverzwakte patiënten, waaronder mucoviscidose patiënten, is een snelle en accurate identificatie van hun koloniserende pathogenen cruciaal, maar echter veelal problematisch gezien hun specifieke klinische context.Matrix asissted laser desorption/ionization time-of-flight massaspectrometrie (MALDI-TOF MS) is een moleculaire identificatiemethode die recent zijn opmars heeft gemaakt in de klinische laboratoria. Deze techniek is snel en eenvoudig in gebruik, maar bevat nog een aantal tekortkomingen vooral bij de moeilijk te identificeren bacteriën, zoals nonfermenters en mycobacteria. Ter validatie van de MALDI-TOF MS identificatie van nonfermenters en mycobacteria kan identificatie door middel van sequencing dienst doen als alternatieve identificatiemethode.Sequencing van het 16S rRNA wordt in de literatuur beschreven als een goede identificatiemethode voor de meeste bacteriën, echter identificatie tot op species niveau bij nauw verwante bacteriën, waarbij onderling het 16S rRNA sterk gelijkend is, zorgt soms voor problemen. Dit blijkt na toepassing van de volledige sequencing procedure op een set van eenvoudig te identificeren Grampositieve en Gramnegatieve bacteriën, die via sequentie van het 16S rRNA gen aanleiding gaf tot een eenduidige identificatie.

16S rRNA. --- Cystic Fibrosis. --- H365-vertaalwetenschappen. --- H520-algemene-germaanse-filologie. --- Identificatie. --- Klinische genetica. --- MALDI-TOF MS. --- Mycobacteria. --- Nonfermenters. --- P320-nucleïnezuren. --- Pathogenen. --- Sequencing. --- T490-biotechnologie.