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Dissertation
Evaluation de l'efficacité in vitro d'agents microbiens de lutte biologiques vis-à-vis du champignon responsable de la fusariose (Fusarium oxysporum f.sp. cubense) chez le bananier
Authors: --- --- --- --- --- et al.
Year: 2022 Publisher: Liège Université de Liège (ULiège)

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Abstract

Fusarium oxysporum f.sp.cubense (Foc) constitue actuellement une menace pour la culture du bananier au niveau mondial. Dans le cadre de ce travail, une évaluation de l’efficacité de certains agents microbiens de lutte biologique (ALBs) a été effectuée afin de développer une gestion efficace et durable du Foc chez Musa sp. Les expérimentations in vitro se sont déroulées dans le laboratoire de Phytopathologie Intégrée et urbaine/Gembloux Agro-Bio Tech/ULiège. Un total de 15 agents microbiens de lutte biologique (6 champignons, 5 levures et 4 bactéries) et le Foc (3 races R1, R2 et TR4) ont été utilisés. Les méthodes in vitro de confrontation directe (co-culture) et indirecte (exposition du Foc aux COVs) ont été utilisées. Les milieux PDA et LB ont été utilisés pour la confrontation directe entre Foc- et les ALB eucaryotes et procaryotes respectivement. Une pastille de 6 mm du Foc (3 races) et celle d’agents microbiens fongiques étaient placées dans la boite de Petri à des distances égales de 30 mm. Des stries pour les souches de levures ou de bactéries ont été réalisées et placées à des distances égales de 30 mm avec la pastille du Foc. Un contrôle négatif a été employé selon le milieu de culture. Pour la confrontation indirecte, deux boites de Petri ont été scellées ensemble, de sorte que celle contenant le Foc soit au-dessus. Un contrôle négatif selon le milieu de culture a été pris en compte. Un deuxième test a été effectué pour les souches microbiennes présentant des effets inhibiteurs élevés. Il s’agissait d’étaler les ALBs sur milieu respectif (PDA ou LB) dans une boîte de Petri et placer une pastille du Foc (3 races) au centre. Les diamètres mycéliens du Foc ont été mesurés quotidiennement pour les deux méthodes pendant 10 jours. Les diamètres mycéliens du Foc vers les ALBs ont été aussi mesurés au dixième jour. Le pourcentage d’inhibition a été calculé au 10e jour. Cladosporium endophytica (1HC.E) a présenté un taux d’inhibition plus élevé vis-à-vis de Foc R1 (73%) et de Foc R1 (70%). Tandis que pour le Foc TR4, Trichoderma asperellum PR12 a présenté le taux d’inhibition le plus élevé (60%) en confrontation directe. En confrontation indirecte, les mêmes agents microbiens ont présenté les meilleurs effets inhibiteurs. Par rapport aux deux méthodes, il s’observe que la R1 et R2 sont plus inhibées en confrontation directe que la TR4. Tandis que la R2 et TR4 sont plus inhibées que la R1 par leur exposition aux COVs. 
Mots-clés : Fusarium oxysporum f.sp. cubense, ALBs, in vitro, TR4, COVs, inhibition


Dissertation
Contribution à la détection des différentes races de Fusarium Wilt. dans les systèmes bananiers des tropiques de Cochabamba (Bolivie) et conseils de gestion
Authors: --- --- --- --- --- et al.
Year: 2022 Publisher: Liège Université de Liège (ULiège)

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Abstract

La banane est une ressource importante au niveau mondial, principalement en termes de sécurité alimentaire et pour la prospérité économique et sociale de nombreuses économies. Pourtant, elle est menacée par la maladie de Panama causée par Fusarium oxysporum f. sp. cubense. Ce travail a pour but de réaliser un état des lieux de la présence de ce pathogène, des connaissances sur la maladie et sur sa gestion dans la région productrice de bananes du département de Cochabamba en Bolivie. L’étude a été réalisée via la détection PCR sur 27 échantillons provenant de prélèvements sur des pseudo-troncs de bananiers, ainsi que via la réalisation d’entretiens semi-directifs. Les résultats concluent, d’une part, que la race 1 et la race tropicale 4 n’ont pas pu être mises en évidence. D’autre part, que les connaissances des acteur.rices de la filière bananière ne sont pas suffisantes que pour réaliser des diagnostics de terrain fiables. Cependant, leurs connaissances ne sont pas nulles, au contraire, le potentiel pour la mise en place de mesures de prévention que les personnes cibles pourront intégrer rapidement est grand. Dans cette perspective, des conseils de gestion sont avancés


Book
Bioactive Molecules from Extreme Environments II
Author:
Year: 2021 Publisher: Basel, Switzerland MDPI - Multidisciplinary Digital Publishing Institute

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Abstract

This Special Issue, as a continuation of the previous Special Issue, “Bioactive Molecules from Extreme Environments” (https://www.mdpi.com/journal/marinedrugs/special_issues/Extreme_Environments accessed on 4 November 2021), includes 10 research articles and 2 reviews, providing a wide overview of the chemical biodiversity offered by different marine organisms inhabiting extreme environments to be used for biotechnological and pharmaceutical applications. The six articles in this Special Issue are focused on the polar regions, which represent an untapped source of marine natural products and are still largely unexplored compared to more accessible sites. Many of these articles refer to Antarctica, which is the coldest and most inaccessible continent on the Earth, where extreme temperatures, light and ice have selected biological communities with a unique suite of bioactive metabolites. The marine organisms of Arctic and Antarctic environments are a reservoir of natural compounds, exhibiting huge structural diversity and significant bioactivities that could be used in human applications.

Keywords

Arctic/Antarctic --- marine bioprospecting --- marine natural product --- terpene --- terpenoid --- biotechnological application --- drug discovery --- microalgae --- Muriellopsis --- spray drying --- freeze-drying --- lutein --- supercritical fluid extraction --- cyclic tripeptides --- antibacterial --- Antarctica sponge-derived fungus --- Aspergillus insulicola --- psychrophiles --- Antarctic bacteria --- Lipopolysaccharide (LPS) --- lipid A --- structural characterization --- MALDI-TOF mass spectrometry --- marine natural products --- Mollusca --- Gastropoda --- chemical ecology --- crustin --- antimicrobial peptides --- shrimp --- deep-sea hydrothermal vent --- deep-sea microorganism --- fungus --- Penicillium griseofulvum --- anti-food allergy --- fungal metabolites --- Paenibacillus --- Arctic --- Svalbard --- Marfey’s method --- DP4 calculation --- quinone reductase --- lipopeptide --- 3-amino-2-pyrrolidinone --- green synthesis --- biomaterials --- metal --- antibiotics --- nanotechnology --- deep sea natural products --- Mariana Trench --- Dermacoccus abyssi MT 1.1T --- 13C-NMR chemical shift linear and multiple regression --- (DFT)-UV-Vis spectral calculation --- phenoxazine --- dermacozine --- absorption maxima in the near infrared region --- Antarctica --- sponges --- mycalols --- marine biotechnology --- antifungal activity --- Bacillus amyloliquefaciens --- Panama disease --- Fusarium oxysporum f. sp. cubense --- bioactive compound --- iturin A5 --- n/a


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Bioactive Molecules from Extreme Environments II
Author:
Year: 2021 Publisher: Basel, Switzerland MDPI - Multidisciplinary Digital Publishing Institute

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Abstract

This Special Issue, as a continuation of the previous Special Issue, “Bioactive Molecules from Extreme Environments” (https://www.mdpi.com/journal/marinedrugs/special_issues/Extreme_Environments accessed on 4 November 2021), includes 10 research articles and 2 reviews, providing a wide overview of the chemical biodiversity offered by different marine organisms inhabiting extreme environments to be used for biotechnological and pharmaceutical applications. The six articles in this Special Issue are focused on the polar regions, which represent an untapped source of marine natural products and are still largely unexplored compared to more accessible sites. Many of these articles refer to Antarctica, which is the coldest and most inaccessible continent on the Earth, where extreme temperatures, light and ice have selected biological communities with a unique suite of bioactive metabolites. The marine organisms of Arctic and Antarctic environments are a reservoir of natural compounds, exhibiting huge structural diversity and significant bioactivities that could be used in human applications.

Keywords

Research & information: general --- Chemistry --- Arctic/Antarctic --- marine bioprospecting --- marine natural product --- terpene --- terpenoid --- biotechnological application --- drug discovery --- microalgae --- Muriellopsis --- spray drying --- freeze-drying --- lutein --- supercritical fluid extraction --- cyclic tripeptides --- antibacterial --- Antarctica sponge-derived fungus --- Aspergillus insulicola --- psychrophiles --- Antarctic bacteria --- Lipopolysaccharide (LPS) --- lipid A --- structural characterization --- MALDI-TOF mass spectrometry --- marine natural products --- Mollusca --- Gastropoda --- chemical ecology --- crustin --- antimicrobial peptides --- shrimp --- deep-sea hydrothermal vent --- deep-sea microorganism --- fungus --- Penicillium griseofulvum --- anti-food allergy --- fungal metabolites --- Paenibacillus --- Arctic --- Svalbard --- Marfey’s method --- DP4 calculation --- quinone reductase --- lipopeptide --- 3-amino-2-pyrrolidinone --- green synthesis --- biomaterials --- metal --- antibiotics --- nanotechnology --- deep sea natural products --- Mariana Trench --- Dermacoccus abyssi MT 1.1T --- 13C-NMR chemical shift linear and multiple regression --- (DFT)-UV-Vis spectral calculation --- phenoxazine --- dermacozine --- absorption maxima in the near infrared region --- Antarctica --- sponges --- mycalols --- marine biotechnology --- antifungal activity --- Bacillus amyloliquefaciens --- Panama disease --- Fusarium oxysporum f. sp. cubense --- bioactive compound --- iturin A5 --- Arctic/Antarctic --- marine bioprospecting --- marine natural product --- terpene --- terpenoid --- biotechnological application --- drug discovery --- microalgae --- Muriellopsis --- spray drying --- freeze-drying --- lutein --- supercritical fluid extraction --- cyclic tripeptides --- antibacterial --- Antarctica sponge-derived fungus --- Aspergillus insulicola --- psychrophiles --- Antarctic bacteria --- Lipopolysaccharide (LPS) --- lipid A --- structural characterization --- MALDI-TOF mass spectrometry --- marine natural products --- Mollusca --- Gastropoda --- chemical ecology --- crustin --- antimicrobial peptides --- shrimp --- deep-sea hydrothermal vent --- deep-sea microorganism --- fungus --- Penicillium griseofulvum --- anti-food allergy --- fungal metabolites --- Paenibacillus --- Arctic --- Svalbard --- Marfey’s method --- DP4 calculation --- quinone reductase --- lipopeptide --- 3-amino-2-pyrrolidinone --- green synthesis --- biomaterials --- metal --- antibiotics --- nanotechnology --- deep sea natural products --- Mariana Trench --- Dermacoccus abyssi MT 1.1T --- 13C-NMR chemical shift linear and multiple regression --- (DFT)-UV-Vis spectral calculation --- phenoxazine --- dermacozine --- absorption maxima in the near infrared region --- Antarctica --- sponges --- mycalols --- marine biotechnology --- antifungal activity --- Bacillus amyloliquefaciens --- Panama disease --- Fusarium oxysporum f. sp. cubense --- bioactive compound --- iturin A5

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