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Keloïds consist of pathologic fibrosis, which occurs in the skin after trauma and which grows beyond the boundaries of the injury. These cutaneous lesions are formed by excessive deposition of extracellular matrix, mainly collagen. Keloids occur in populations from several racial backgrounds; however, keloids are 15 times more common in the African-American and African than in the Caucasian population. The causative genes are still unknown, but several genetic Ioci have been described. We studied a Belgian family with keloïds and hypertrophic scars. Ail family members were screened using Affymetrix SNP-chips. Linkage analysis excluded ail known loci and showed a significative linkage to 1q32-q41 region containing 140 genes. We performed pathway analysis by ranking the 140 genes using data from several databases (KEGG, GO) against a training list of genes known to be related to keloïds on the basis of their expression profiling and/or immunohistochemistry. Several candidate genes were selected based on their p-values. One of them was the transforming growth factor beta 2 (TGFβ2), which plays a central role in collagen synthesis. Complete coding sequence of TGFβ2 was sequenced. Two variants were identified: an insertion of ACAA in 5’UTR (106 bp before start codon) and a substitution (A>T) in the 3’UTR (100 bp after stop codon). Both nucleotide changes are reported as polymorphisms in dbSNP. Mitogen-activated Protein Kinase Protein Kinase 2 (MAPKAPK2) was selected as the second candidate gene, on the basis of the knock-out mice, which have delayed wound healing and impaired collagen deposition. The coding parts were sequenced and three substitutions were 4ound: (A>G); Thr25Ala in the first exon, (C>T); 42bp before the third exon and, (C>T); 8bp after the fourth exon. None of these three changes was found in dbSNP. Bioinformatic analyses of the likely impact of the non-coding variants were per[ormed but, in the abscence of fresh tissue, we could not test the impact of these mutations on mRNA splicing of MAPKAPK2. The coding variant is predicted to be benign on PolyPhen analysis and non-deleterious on Panther analysis. Thus, neither one of these perfect positional candidate genes seems to be the causative gene for keloïds and hypertrophies scars in this 1q32-q41 locus Les chéloïdes sont un type de fibrose pathologique qui survient au niveau de la peau après une lésion et qui s’étendent au-delà des limites de la blessure. Ces lésions cutanées sont formées par un dépôt excessif de matrice extracellulaire, surtout du collagène. Les chéloïdes se forment dans des populations d’origines différentes, mais sont 15 fois plus fréquentes chez les Afro-américains et Africains par rapport à la population caucasienne. Les gènes causatifs sont encore inconnus, mais plusieurs loci ont déjà été décrits. Nous avons étudié une famille belge avec à la fois des chéloïdes et des cicatrices hypertrophiées. Dix-milles SNPs ont été génotypés dans 16 membres à l’aide d’une puce Affymetrix. L’analyse de liaison exclut tous les loci connus et montre un nouveau locus 1q32-q41 de Lod score 2,3 contenant 140 gènes. Nous avons effectué le classement par le programme Endeavour des 140 gènes en combinant plusieurs bases de données. Plusieurs gènes candidats ont été sélectionnés. L’un d’eux est le transforming growth factor beta 2 (TGFβ2) qui joue un rôle central dans la synthèse du collagène. Les séquences transcrites du TGFβ2 ont été séquencées dans 6 patients de 6 familles différentes. Deux variantes ont été identifiées : une insertion de «ACAA» en 5’UTR (106 pb avant le codon d’initiation) et une substitution (A>T) en 3’UTR (100 pb après le codon stop). Ces deux changements sont répertoriés comme des polymorphismes dans dbSNP132. Le 2eme gène candidat sélectionné est la mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2 (MAPKAPK2). En plus, la souris mutant (MAPKAPK2-/-) présente un retard de cicatrisation et un dépôt de collagène inférieur par rapport aux souris sauvage. Trois substitutions ont été trouvées: (A>G); T25A dans le premier exon, (C>T); 42bp avant le troisième exon, et (C>T); 8bp après le quatrième exon. Seul le 2ème changement a été rapporté dans dbSNP132. L’impact du changement T25A est prédit comme bénin par PolyPhen et non délétère par Panther. En l’absence de tissu frais, nous n’avons pas pu tester l’impact réel de ces changements sur épissage de l’ARNm de MAPKAPK2. Ce changement co-ségrége dans 9 patients sur 12 patients testés. D’autres analyses approfondies seront nécessaire pour impliquer ce gène dans la formation des chéloïdes
Keloid --- Case-Control Studies --- Transforming Growth Factor beta2
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