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ULiège (4)


Resource type

dissertation (4)


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French (3)

English (1)


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2024 (1)

2020 (1)

2016 (1)

2010 (1)

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Dissertation
Caractérisation biochimique et structurale de la métallo-β-lactamase VIM-4 : sélection de nouveaux inhibiteurs de métallo-β-lactamases
Authors: ---
Year: 2010 Publisher: [S.l.]: [chez l'auteur],

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Abstract

Keywords


Dissertation
Utilisation d'un phage ingénié comme outil de décontamination spécifique des eaux

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Keywords


Dissertation
Mise au point d'un protocole de quantification de l'alpha-synucléine agrégée dans des extraits cérébraux de souris transgéniques, modèles de la maladie de Parkinson
Authors: --- --- --- ---
Year: 2020 Publisher: Liège Université de Liège (ULiège)

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Abstract

La maladie de Parkinson (MP) appartient à une classe de pathologies neurodégénératives, appelées α-synucléinopathies. Elles seraient liées à l’agrégation de l’α-synucléine (aSyn) dans certaines régions du système nerveux central.1 Le diagnostic clinique de la MP permet l’instauration d’un traitement symptomatique généralement tardif. Cependant, ce diagnostic clinique est erroné dans 25% des cas.6,9
Ce mémoire s’inscrit au sein du projet « DiaSyn » qui vise à développer un radiotraceur des agrégats d’aSyn intracellulaire dans le parenchyme cérébral. Ce radiotraceur permettra de poser un diagnostic de certitude non invasif de la MP par l’utilisation d’une neuro-imagerie.
Une sonde moléculaire spécifique des agrégats d’aSyn faisant intervenir un nanobody (Nb) a été produite préalablement. Des études préliminaires ex vivo ont démontré que ce Nb était capable de traverser la barrière hématoencéphalique (BHE), de diffuser à travers le parenchyme cérébral, et de pénétrer les cellules nerveuses afin d'interagir avec les agrégats d’aSyn. Néanmoins, le PET (Positon emission tomography) réalisé après une injection intraveineuse (IV) du Nb-18F-Tétrazine dans la queue de souris modèle de la MP, n’a montré aucun signal dans le parenchyme cérébral. Diverses hypothèses peuvent être émises pour expliquer ce résultat. D’une part, la quantité de Nb traversant la BHE serait insuffisante du fait d'une clairance rénale élevée (T1/2 plasmatique = 10 à 30min). D’autre part, il se peut que la quantité d’agrégats d’aSyn présente au sein du parenchyme cérébral lors de la réalisation du PET soit insuffisante pour permettre leur détection par PET. Il faudrait donc corréler l’intensité du signal PET avec la quantité d’agrégats d’aSyn présente dans les neurones, et la quantité de Nb passant la BHE. La mise au point d’un protocole de quantification de l’aSyn agrégée phosphorylée et du Nb sera donc envisagée durant ce mémoire, en utilisant le BLI-ELISA « sandwich ». Pour ce faire, des nanobodies spécifiques de l’aSyn agrégée phosphorylée (pS129) devront être générés et produits au sein d’une banque de phage-Nb immune, nommé Tournesol.
Six phages-Nb spécifiques de l’aSyn-pS129 ont permis de produire les Nbs dans E.coli, nommés NbSynIP. Les résultats préliminaires de la caractérisation de ces NbSynIP montre que seule 2 Nbs interagissent avec l’aSyn. La poursuite de la caractérisation des NbSynIP et la mise au point du protocole de quantification de l’aSyn agrégée seront envisagés dans la partie « perspectives ».


Dissertation
Thesis, COLLÉGIALITÉ
Authors: --- --- --- ---
Year: 2024 Publisher: Liège Université de Liège (ULiège)

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Abstract

Staphylococcus epidermidis (S. epidermidis) are bacteria present in the human skin and mucosal microbiota in which they play a commensal role. Nevertheless, several events, such as surgical procedures, benefit S. epidermidis entry into the host organism and represent the starting point for their pathogenicity. Their ability to form biofilms on indwelling medical devices and to develop antibiotic resistance renders their eradication challenging and makes them responsible of most nosocomial infections. Ticagrelor, an antiplatelet drug targeting the platelet receptor P2Y12, has been shown to possess interesting antibacterial activity against Gram-positive bacteria. However, due to platelet inhibition, ticagrelor usage increases bleeding risk, which makes it unsuitable for routine antibiotic treatment. Polyurethane (PU), the most used polymer for medical devices manufacturing, shows propensity to facilitate bacterial adhesion, which is the first step of biofilm formation. There is therefore a need for developing polymers with antibacterial and anti-biofilm properties. Moreover, PU synthesis requires the use of toxic precursors (isocyanates), which highlights the need for a switch to safer alternatives, such as non-isocyanate PU (NIPU). In this work, we hypothesized that ticagrelor pyrimidine derivatives, labelled 2329, 2666, 2840 and 2460, devoid of antiplatelet activity, could exert an antibacterial activity against S. epidermidis similar to ticagrelor. We also wanted to know whether NIPUs (named PHOx and Net4) that showed proven biocompatibility, could show reduced bacterial adhesion as compared to conventional PU. Finally, we aimed to assess whether these NIPUs could be impregnated with ticagrelor derivatives, thereby exerting antibacterial activity.
The antibacterial activity of pyrimidine derivatives and ticagrelor was evaluated via the determination of minimal inhibitory and bactericidal concentrations (MIC and MBC, respectively) against S. epidermidis. Their biocompatibility was assessed through a hemolysis assay, and a cytotoxicity assay in the presence of various eukaryotic cells. S. epidermidis adhesion on PHOx and Net4 polymers, as well as PU (medical grade), was analysed by microcalorimetry. These polymers were then impregnated with ticagrelor derivatives and tested for their antibacterial properties. All tests were performed using two laboratory strains of methicillin-resistant S. epidermidis (MRSE).
The results showed that 2329 and 2666 derivatives possessed overall interesting antibacterial activity. The molecules were not cytotoxic at MIC and they did not provoke hemolysis. Moreover, among the two NIPUs tested for bacterial adhesion, PHOx showed significantly reduced bacterial adhesion compared to control polymers. Unfortunately, molecules-impregnated polymers did not display antibacterial properties.

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