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En mer Méditerranée, la pollution plastique est un véritable fléau. Des plastiques de toutes les tailles peuvent être retrouvés dans tous les compartiments du bassin méditerranéen et plus particulièrement au fond de la mer, dans les sédiments ou se concentre la grande majorité des particules plastiques. Un moyen utilisable pour étudier cette pollution serait les holothuries.
L’objectif de cette étude consiste à vérifier si les holothuries de la baie de Calvi sont utilisables comme espèces bio-indicatrices de la pollution plastiques dans la baie de Calvi en Corse en étudiant le contenu en plastiques du tube digestif de ces holothuries. Pour ce faire des individus appartenant aux espèces Holothuria tubulosa et Holothuria poli ont été récoltés au niveau de trois sites de la baie : le port de la station STARESO, l’émissaire en mer des eaux usées de la commine de Calvi et en dessous d’une ferme aquacole. Le tube digestif est extrait de l'individu via une dissection, puis digéré par une méthode alcaline-oxydante pour en extraire le sédiment. Ce sédiment est ensuite observé à la loupe binoculaire pour recenser les plastiques présents selon quatre catégories : les fibres et filaments, les gommes, les films et les fragments de plastiques. Pour tester les rejets plastiques au niveau de l'émissaire durant la période touristique, les résultats sur ce site sont comparés à ceux d'holothuries provenant du même site, mais prélevées hors de la période touristique.
Suite aux manipulations, il a été possible de mettre en évidence des différences significatives entre les trois sites de récoltes en termes de nombre d’items plastiques et de composition des populations de plastique. Le site de l’aquaculture contient le plus de plastiques et le site de l’émissaire présente la quantité la plus faible. Il est donc possible de détecter des variations de contenu en plastique et de composition entre les différents sites de récolte. Cependant, il n’a pas été possible de montrer une différence significative entre les deux périodes de récolte, mais il est probable que ce soit une conséquence du confinement stricte qui était en place en Corse lors de la période de récolte.
Il est donc possible d’utiliser les holothuries pour étudier la pollution plastique d’un milieu et, théoriquement, les variations des quantités de plastiques dans les sédiments d’un site. Des recherches ultérieures pourraient permettre d’étudier l’évolution de la quantité de plastique au niveau d’un ou plusieurs sites sur une période donnée pouvant aller de quelques mois à plusieurs années. In the Mediterranean Sea, plastic pollution is a real scourge. Plastics of all sizes can be found in all compartments of the Mediterranean basin and more particularly at the bottom of the sea, in the sediments where the vast majority of plastic particles are concentrated. One way of studying this pollution would be with sea cucumbers.
The objective of this study is to verify whether sea cucumbers from Calvi Bay can be used as bioindicator species for plastic pollution in Calvi Bay in Corsica by studying the plastic content of the digestive tract of these sea cucumbers. To do this, individuals belonging to the species Holothuria tubulosa and Holothuria poli were collected at three sites in the bay: the port of the STARESO station, the sea outfall of the Calvi municipality's waste water and below an aquaculture farm. The digestive tract is extracted from the individual via dissection, then digested by an alkaline-oxidising method to extract the sediment. This sediment is then observed under a binocular magnifying glass to identify the plastics present in four categories: fibers and filaments, gums, films and plastic fragments. To test for plastic discharges at the outfall during the tourist period, the results from this site are compared with those from sea cucumbers from the same site, but collected outside the tourist period.
Following the manipulations, it was possible to highlight significant differences between the three harvesting sites in terms of the number of plastic items and the composition of the plastic populations. The aquaculture site contains the most plastics and the outfall site has the least. It is therefore possible to detect variations in plastic content and composition between the different harvest sites. However, it was not possible to show a significant difference between the two harvest periods, but it is likely that this is a consequence of the strict containment that was in place in Corsica during the harvest period.
It is therefore possible to use sea cucumbers to study the plastic pollution of an environment and, theoretically, the variations in the quantities of plastics in the sediments of a site. Further research could allow the evolution of the quantity of plastic at one or more sites to be studied over a period of time ranging from a few months to several years.

Holothurie --- Micro-plastiques --- Calvi --- Méditerranée --- Holothuria tubulosa --- Holothuria poli --- Sciences du vivant > Sciences aquatiques & océanologie

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Sea surface temperature (SST) is a very important variable to assess numerous physical and biological phenomena, most notably the ocean’s impact on the recent climatic changes. It’s also a parameter that can be measured regularly and over the entire surface of the oceans and seas thanks to satellites. The major issue with those measurements are data breaches due to clouds. Numerous softwares can approximate the lacking data with various methods, one of those being the use of a neural network with a U-Net architecture (Siddique et al, 2021) named DINCAE (Data-Interpolating Convolutional Auto-Encoder) (Barth et al., 2020 et 2022).

This report aims to improve the reliability of the reconstructions made by DINCAE at differing scales, most notably small scales, with 5 or 6 neural layers. To achieve this, it will focus on the use of skip-connections between the input and the output of different layers. The reliability assessment will be done in 2 ways. +The first one is to evaluate the RMS error of the reconstructed data compared to the initial data, including purposefully removed data then restored. The second one is to assess the amount of variance kept by the software as reconstruction softwares are known to under-estimate it. This assessment is done annually and seasonally. The study zone chosen for this report is the Alboran sea, the most western part of the Mediterranean sea.

The work’s result shows the most optimal skip-connections to use are dependent on the scales and period studied. No configuration could be found to both minimize the RMS error as well as to maximize the variance, we thus need to find a trade-off between the two. However, a 6 layers configuration with a skip-connection on each of the first 5 layers has been found to minimize the RMS error, while a 6 layers configuration with a skip-connection only on the second layer has been found to keep the most variance in the system over the entire year at most scales, although it’s not the best over each and every one of the season.

Sciences du vivant > Sciences aquatiques & océanologie

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L'aquaculture de la crevette géante tigrée (Penaeus monodon) représente une industrie de 
grande envergure à l'échelle mondiale, avec une prédominance marquée en Asie. Bien que 
l'Afrique possède des atouts potentiels pour développer cette activité, sa participation à la 
production mondiale demeure négligeable. Cette différence notable entre les continents soulève 
des questions essentielles concernant les facteurs de réussite en Asie et les obstacles freinant le 
développement de cette industrie en Afrique. 
Ainsi, Notre étude vise à analyser l'évolution de cette aquaculture entre l'Afrique et l'Asie, en 
identifiant les facteurs influençant la production. Pour ce faire, une méthodologie rigoureuse a 
été employée, comprenant l’observation des données de la FAO, l’identification des pays 
producteurs, l’extraction des données pour la création des graphiques, une recherche 
bibliographique approfondie, l’élaboration de tableaux récapitulatifs et une analyse SWOT pour 
évaluer la faisabilité de cette aquaculture au Cameroun. 
Nos résultats montrent que l’Asie, grâce à des investissements massifs, des technologies 
avancées, des pratiques d’aquaculture bien établies, des conditions climatiques favorables et un 
savoir-faire technique éprouvé, reste le leader incontesté dans la production de crevettes géantes 
tigrées. Par contre, l’Afrique, malgré son potentiel considérable, reste largement sous-exploitée 
en raison d’un manque d’infrastructures adéquates, de faibles investissements et de défis tels 
que l'instabilité politique et les faibles capacités techniques. Néanmoins, certains pays africains, 
comme Madagascar, commencent à émerger comme des acteurs potentiels dans ce domaine, 
grâce à des initiatives de développement durable et des partenariats internationaux. 
Cette étude offre des informations précieuses pour les décideurs politiques, les chercheurs et 
les praticiens de l’aquaculture, en soulignant les tendances, les opportunités et les défis de 
l’aquaculture de la crevette géante tigrée en Afrique et en Asie.

Aquaculture, Crevette géante tigrée, Penaeus Monodon, Afrique, Asie, FAO, Comparaison, Évolution. --- Physique, chimie, mathématiques & sciences de la terre > Sciences de la terre & géographie physique

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La mise en place d’aires marines protégées (MPA) est l’outil le plus utilisé
actuellement afin de protéger la biodiversité marine. Cependant, un grand nombre de celles-ci
ne présentent pas de contrôles actifs, laissant place à la pêche illégale et n’atteignent dès lors
pas leurs objectifs. Cette pêche peut impacter l’écosystème en visant de manière préférentielle
certaines espèces de poissons tels que les poissons perroquets et les grands prédateurs,
pouvant entrainer un effet en cascade sur le reste de l’écosystème. Face à cela, la vigilance
citoyenne mise en place grâce aux activités éco-touristiques peut permettre un contrôle
presque permanent et ainsi augmenter l’efficacité des MPA. Dans la Baie de la Paz, la MPA à
usages multiples de Balandra présente une zone de non-pêche accueillant de nombreuses
activités écotouristiques, San Rafaelito, ainsi qu’une zone où la pêche artisanale et sportive est
permise, La Gaviota. L’objectif de ce mémoire est d’étudier l’effet de l’absence de pêche
contrôlée grâce à l’écotourisme sur les communautés de poissons récifaux. La richesse
spécifique, la biomasse totale ainsi que la biomasse et la densité d’espèces cibles (Scaridae,
Mycteroperca rosacea, Serranidae benthiques et Lutjanidae) ont été comparées à cet effet
entre San Rafaelito et La Gaviota. Celles-ci ont ensuite été comparées à plus grande échelle
aux sites de la MPA d’Espiritu Santo. Enfin, les compositions des assemblages de poissons
ont été étudiées sur les deux sites. La biomasse ainsi que la densité d’individus de grande
taille des espèces cibles étaient significativement plus élevées à San Rafaelito qu’à La
Gaviota. De plus, San Rafaelito abrite une densité de Mycteroperca rosacea significativement
plus élevée que l’ensemble des no-take zones de la région. La Gaviota présentait une
proportion plus faible d’herbivores et de piscivores que la zone protégée de San Rafelito. Ces
différences amènent une dissemblance des assemblages de poissons récifaux entre les deux
sites d’études. La diminution de la biomasse des espèces cibles au niveau de La Gaviota
pourrait impacter le restant de l’écosystème. En effet les rôles clés joués par les Scaridae ainsi
que les prédateurs (Serranidae et Lutjanidae) pourraient être réduits sur ce site. Ainsi,
l’herbivorie et la bio-érosion pourraient être réduites de la même manière que le contrôle top-down mis en place par les prédateurs. Cela pourrait en partie expliquer les différences de
compositions que nous avons observées entre ces deux sites. La diminution des individus de
grande taille au niveau de La Gaviota pourrait par ailleurs impacter la reproduction de
certaines espèces. Ainsi, les impacts de la pêche artisanale et sportive ont pu être mis en
évidence sur le site de La Gaviota, démontrant l’efficacité de la zone de non-pêche de San
Rafaelito.

Sciences du vivant > Sciences aquatiques & océanologie

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Ce mémoire se focalise sur l'étude des variations temporelles du zooplancton et des microplastiques dans la baie de Calvi, une région représentative de la Méditerranée. La recherche a été menée dans le cadre du programme de Master en Océanographie, à finalité approfondie, et a impliqué des prélèvements mensuels de zooplancton et de microplastiques d’août 2023 à avril 2024.

L’objectif principal de cette étude était d’étudier les variations de communautés zooplanctoniques et la présence en microplastiques entre août 2023 et avril 2024 en comparant les données obtenues à la surface et à 1,2 mètre de profondeur grâce à deux types de filet, respectivement le manta et le wp2. 

Les résultats ont révélé une efflorescence algale significative à la fin de l’hiver, causée par une augmentation de la lumière et des nutriments. Cette efflorescence a entraîné une augmentation notable de la biomasse zooplanctonique, démontrant l'importance des changements abiotiques saisonniers. L’abondance a en effet atteint près de 1850 individu/m3. Les analyses ont montré que le zooplancton est plus abondant à une profondeur de 1,2 mètre, échantillonnée par le filet wp2, comparativement à la surface, échantillonnée par le filet manta. 

Concernant les microplastiques, les résultats ont indiqué une concentration plus élevée à la surface de l’eau, capturée par le filet manta. 

En conclusion, ce mémoire a enrichi notre compréhension des interactions complexes entre le zooplancton et son environnement marin vulnérable. Il a également mis en évidence des différences significatives au sein des communautés zooplanctoniques, en fonction de la profondeur d’échantillonnage, même quand cette différence de profondeur reste faible.

zooplancton, océanographie, microplastique, Calvi, --- Sciences du vivant > Sciences aquatiques & océanologie