Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Indicators (Biology). --- Nematodes --- Ecology.

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Sinds de publicatie van zijn genoom in 1998, heeft de kleine bacteriovore bodemnematode C. elegans de status van een supermodel verworven. Deze worm wordt niet alleen gebruikt als model voor de studie van parasitaire nematoden, maar ook voor de studie van menselijke ziektegenen. Bij de moderne plaagbestrijding en in de geneeskunde vormen G-proteïne gekoppelde receptoren (GPCRs) de belangrijkste groep van moleculaire doelwitmoleculen voor zowel bestrijdingsmiddelen als therapeutische geneesmiddelen. Neuropeptiden vormen een belangrijke klasse van GPCR liganden. Het zijn kleine boodschappermoleculen die een hoge hiërarchische positie bekleden in de dierenfysiologie. Via hun receptoren reguleren ze tal van biologische processen zoals voortplanting, suiker- en vetmetabolisme, voedselopname, vertering, voortbeweging, waterhuishouding, enz. Ondanks het feit dat zijn genoomsequentie reeds langer dan een decennium gekend is, is er slechts zeer weinig geweten over neuropeptiderge signaaltransductie bij C. elegans. Het C. elegans genoom codeert voor een 50-tal neuropeptide GPCRs, waarvan er voor de aanvang van deze studie amper zeven gekarakteriseerd waren. Dit illustreert de moeilijkheden bij het ontrafelen van signaaltransductiewegen. Deze studie beoogt de karakterisering van twee neuropeptide GPCR signaalwegen. De eerste signaalweg is homoloog met de gonadotropine-releasing hormoon (GnRH) signaalweg bij vertebraten en de adipokinetisch hormoon (AKH) signaalweg bij insecten. De tweede signaalweg is homoloog met de neuromedine U (NMU) signaalweg bij vertebraten en de pyrokinine (PK) signaalweg bij insecten. Voor beide neuropeptiderge signaalwegen in C. elegans hebben we een combinatie gebruikt van bio-informatica en omgekeerde farmacologie om de receptoren te ontwezen. Met behulp van RNAi hebben we functionale analyses uitgevoerd en met behulp van immunokleuringen lokalisatie-experimenten. Bij zoogdieren is GnRH een belangrijk neuropeptide dat de vrijzetting van gonadotropines stimuleert in de hypofyse. Het al dan niet bestaan van een functionele equivalent van de voortplantingsas bij protostome invertebraten heeft lange tijd ter discussie gestaan. In deze studie hebben we het ligand gevonden voor de GnRH receptor bij C. elegans (Ce-GnRHR) door gebruik te maken van bio-informatica. Het peptide en zijn precursor zijn homoloog met zowel AKH bij insecten als met GnRH bij tunicaten en hogere vertebraten. We hebben het daarom AKH-GnRH-verwant peptide genoemd. We hebben de Ce-GnRH receptor gekloneerd en tot expressie gebracht in HEK293T zoogdiercellen. De Ce-GnRHR werd geactiveerd door zowel het AKH-GnRH-verwant peptide van C. elegans als het AKH van Drosophila. Ook andere nematode AKH-GnRHs die we gevonden hebben in EST databanken activeren de receptor. Analoog aan de signaalweg van AKH bij insecten en GnRH bij vertebraten verloopt de Ce-AKH-GnRH signaaltransductie via een Gαq eiwit met Ca2+ als secundaire boodschapper. Een knock-down van Ce-GnRHR of Ce-AKH-GnRH of beide leidt tot uitstel van het eileggedrag. Dit is vergelijkbaar met een uitgestelde puberteit bij meisjes met een abnormaal lage titer aan GnRH of met een mutatie in het gen voor GnRH of zijn receptor. Onze data ondersteunen de opvatting dat het AKH-GnRH signaalsysteem waarschijnlijk reeds zeer vroeg in de evolutie van de Metazoa is ontstaan. Tevens onderstreept deze studie dat de rol van dit systeem bij de voortplanting allicht ontstaan is voor de splitsing van Protostomia en Deuterostomia. NMU is een neuropeptide bij vertebraten dat structureel zeer sterk geconserveerd is en voornamelijk aanwezig is in de hypofyse en het gastro-intestinale stelsel. Twee neuropeptidegenen die coderen voor PK peptiden bij Drosphila, namelijk capability (capa) en hugin, zijn mogelijke insect homologen van vertebraat NMU. In deze studie hebben we het ligand gevonden voor de Ce-PK-R door middel van een bio-informatische analyse. Nadat we de Ce-PK-R gekloneerd en tot expressie gebracht hadden in HEK293T cellen, bleek dat deze receptor geactiveerd werd door een neuropeptide afkomstig van de NLP-44 precursor bij C. elegans. Deze precursor is het equivalent van de CAPA precursor bij insecten aangezien hij codeert voor zowel een PK-achtig peptide als voor twee periviscerokinines (PVKs). Met een immunokleuring in C. elegans hebben we aangetoond dat – analoog aan CAPA peptiden bij insecten en NMU bij vertebraten – de CAPA precursor bij deze nematode tot expressie komt in het zenuwstelsel. Deze data suggereren bovendien dat een ancestrale CAPA precursor reeds aanwezig was in de gemeenschappelijke voorouder van Protostomia en Deuterostomia en dat deze bij insecten zou gedupliceerd zijn, wat daar aanleiding heeft gegeven tot CAPA en HUGIN. Bij vertebraten is NMU vermoedelijk homoloog met het protostome CAPA-PK peptide. De nematode C. elegans blijkt een uitermate geschikt modelorganisme te zijn om neuropeptide signaalwegen te bestuderen die geconserveerd zijn bij vertebraten en invertebraten. Door gebruik te maken van C. elegans kan nu het volledige moleculaire mechanisme van de GnRH en NMU signaalwegen onderzocht worden op organismaal niveau, en dit op hoge doorvoerschaal. Since the publication of its genome in 1998, the small free-living bacteriovorous soil nematode Caenorhabditis elegans has rapidly reached the status of a supermodel, not only as a platform in the study of parasitic nematodes, but also as a model to study selected human diseases. In modern pest control and medicine, G protein-coupled receptors (GPCRs) constitute the most important group of molecular targets for agro-pharmaceutical and therapeutic drugs. An important class of GPCR ligands are neuropeptides. Neuropeptides are small messenger molecules that occupy a high hierarchic position in animal physiology. Via their receptors they fulfill many biological processes and behaviours, like reproduction, sugar and fat metabolism, food intake, digestion, locomotion, water balance, etc. Despite the fact that the completion of its genome occurred more than a decade ago, very little is known about neuropeptide signaling in C. elegans. Its genome encodes about 50 GPCRs predicted to be activated by a neuropeptide, only seven of which were characterized prior to this study. This is indicative for the complexity of unraveling signaling pathways. The present study focuses on the characterization of two GPCR signaling systems. The first pathway is homologous to the gonadotropin-releasing hormone (GnRH) signaling pathway in vertebrates and the adipokinetic hormone (AKH) signaling pathway in insects. The second one is homologous to neuromedin U (NMU) signaling in vertebrates and pyrokinin (PK) signaling in insects. For both C. elegans neuropeptide signaling systems, we used a combination of bioinformatics and reverse pharmacology to deorphanize the receptors. Functional analysis has been performed by means of RNAi and localization experiments by whole mount immunostaining. In mammals, GnRH is a neuropeptide that stimulates the release of gonadotropins from the anterior pituitary. The existence of a putative functional equivalent of this reproduction axis in protostomian invertebrates has been a matter of debate. In this study, the ligand for the GnRH receptor in C. elegan s ( Ce -GnRHR) was found using a bioinformatic approach. The peptide and its precursor are reminiscent of both insect adipokinetic hormones and of GnRH-preprohormone precursors from tunicates and higher vertebrates and was designated Ce -AKH-GnRH. We cloned the Ce -GnRHR and expressed it in mammalian HEK293T cells. The Ce -GnRHR was activated by the C. elegans AKH-GnRH-like peptide as well as by Drosophila AKH and other nematode AKH-GnRHs that we found in EST databases. Analogous to insect AKH and vertebrate GnRH receptor signaling , Ce -AKH-GnRH activates its receptor through a Gαq protein with Ca2+ as second messenger. Gene silencing of Ce -GnRHR or Ce -AKH-GnRH or both resulted in a delay in the egg-laying process. This is comparable to a delay in puberty in humans lacking a normal dose of GnRH peptide or humans with a mutated GnRH precursor or receptor gene. The present data support the view that the AKH-GnRH signaling system probably arose very early in metazoan evolution and that its role in reproduction might have been developed prior to the divergence of Protostomia and Deuterostomia. NMU in vertebrates is a structurally highly conserved neuropeptide of which the highest levels are found in the pituitary and gastrointestinal tract. In Drosophila, two neuropeptide genes encoding PKs, capability (capa) and hugin, are possible insect homologues of vertebrate NMU. In this study, the ligand for an orphan G protein-coupled receptor was found in C. elegan s ( Ce -PK-R) using a bioinformatic approach. After cloning and expressing Ce-PK-R in HEK293T cells, we found that it was activated by a neuropeptide from the C. elegan s NLP-44 precursor. This neuropeptide precursor is reminiscent of insect CAPA precursors since it encodes a PK-like peptide and two periviscerokinin-like peptides (PVKs). Analogous to CAPA peptides in insects and NMUs in vertebrates, whole mount immunostaining in C. elegans revealed that the CAPA precursor is expressed in the nervous system. The present data also suggest that the ancestral CAPA precursor was already present in the common ancestor of Protostomia and Deuterostomia and that it might have been duplicated into CAPA and HUGIN in insects. In vertebrates, NMU is the putative homologue of a protostomian CAPA-PK. The nematode C. elegans appears to be an excellent model to study neuropeptide signaling pathways that are conserved between vertebrates and invertebrates. Using C. elegans, the complete picture of the molecular mechanism of GnRH and NMU signaling can now be further unraveled at the organismal level, and this in a high-throughput way. Mijn onderzoek richt zich op de identificatie, karakterisatie en functie-analyse van receptoren bij de rondwormen, meerbepaald bij het modelorganisme Caenorabditis elegans. We hebben bij deze kleine worm een homologe receptor kunnen karakteriseren aan de gonadotropine-releasing hormoon receptor bij de mens, alsook het ligand dat deze receptor activeert. Bij vertebraten is het neuropeptide hormoon gonadotropine-releasing hormoon cruciaal bij de ontwikkeling van de zogenaamde reproductieve as. Het zorgt ervoor dat de pubertijd op gang komt, dat kinderen gelaschtsrijpe volwassenen worden en dat de secundaire geslachtkenmerken tot uiting komen bij beide seksen. Mutaties in dit gen, of in dat van zijn receptor, kunnen leiden tot tal van aandoeningen en in de meeste gevallen tot steriliteit. We hebben kunnen aantonen bij C. elegans dat neerregulatie van dit signaalsysteem leidt tot uitstel in het eileg proces. Dit is vergelijkbaar met een uitstel in eirijping en ovulatie (leeftijd waarop de pubertijd begint) bij de mens en toont dus aan dit mechanisme achter voortplanting reeds oeroud is en is mee geëvolueerd van zeer primitieve dieren tot de zoogdieren. Verder hebben we ook een receptor bij C. elegans kunnen karakteriseren die homoloog is met de neuromedine U (NMU) signaalweg bij vertebraten en de pyrokinine (PK) signaalweg bij insecten. NMU is een neuropeptide bij vertebraten dat structureel zeer sterk bewaard is gebleven doorheen de evolutie en voornamelijk aanwezig is in de hypofyse en het spijsverteringsstelsel. De functie van deze signaalweg bij C. elegans hebben we echter tot op heden niet kunnen ophelderen en blijft een uitdagende taak voor de toekomst. Onze data suggereren dat beide signaalwegen al aanwezig waren bij de gemeenschappelijke voorouder van vertebraten en invertebraten, die zeer lang geleden leefde. De nematode C. elegans blijkt een uitermate geschikt modelorganisme te zijn om neuropeptide signaalwegen te bestuderen die bewaard zijn bij vertebraten en invertebraten. Door gebruik te maken van C. elegans kan nu het volledige onderliggende moleculaire mechanisme van de GnRH en NMU signaalwegen onderzocht worden op organismaal niveau, en dit op hoge doorvoerschaal.

Academic collection --- 595.132 --- 577.175.2/.7 --- 577.175.2/.7 Animal hormones --- Animal hormones --- 595.132 Nematodes. Roundworms. Threadworm. Eelworm. Vinegar eel. Gapeworm. Hookworm --- Nematodes. Roundworms. Threadworm. Eelworm. Vinegar eel. Gapeworm. Hookworm --- Theses

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Plant-parasitic nematodes are among the most destructive plant pathogens, causing enormous losses to agronomic crops worldwide. This book provides an up-to-date review of research related to two of the most important nematode pests, root-knot and cyst nematodes. Chapters cover early plant-nematode interactions, identification of nematode proteins important in the establishment of nematode feeding sites, and classification of biochemical and signaling pathways significant in the development of specialized feeding sites in the host. The cellular and subcellular structures essential for parasitic interaction are examined using light and electron microscopy. Modern techniques of gene expression analysis and genomic sequencing promise to provide an even greater wealth of information to researchers, enabling them to develop and examine natural and manmade mechanisms of resistance to this important plant pest.

parasitologie --- histologie --- Histology. Cytology --- systematische plantkunde --- Plant physiology. Plant biophysics --- Botany --- cytologie --- General parasitology --- planten --- Nematode-plant relationships --- Root-knot --- Cyst nematodes --- Cytology --- EPUB-LIV-FT LIVBIOLO LIVBIOMO LIVMEDEC SPRINGER-B

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

The fourth volume of the IPMD Series covers, in three Sections, emerging issues in the integrated management of main nematode parasites of fruit, tree and forest crops. The chapters provide basic data about the crops concerned, listing main nematode threats, in order to facilitate their detection and management. Special attention is given to the management strategies as experienced by farmers, nematologists and consultants, in different areas of the world, including exploitation of plant resistance sources and integrated or organic management. The first Section covers key nematode parasites of tropical fruit crops, including banana, cocoa, coffee, citrus and other tropical crops, and the related management options. In the second Section, nematode problems of grapevine and other Mediterranean crops like pistachio, Prunus spp. and olive are revised. Epidemiology data and management options are given, ranging from the status of grapevine resistance to vector species, to available chemicals, plant quarantine schemes and virus vectors control tools. In the third final Section, an updated review of Pine Wilt Nematode is provided, with new data on the threat represented by its spreading in Western Europe. The book approaches a broad range of subjects in a traditional way, with dedicated and detailed chapters, written by experienced nematologists, on defined topics. This approach provides a focus on the nematological issue of interest or that the reader has to afford, allowing the problem identification and illustrating the solutions developed and experienced by the authors. The general aim of the book, in an integration effort with Vol. 2 of the same IPMD series, is to provide updated background data together with a range of solutions for important nematode pests, worldwide. The volume is directed to students, technicians, extensions and scientists, providing contents of a professional level. Basic concepts and practical examples are provided, useful to enable the reader to analyse and act in relation to his own conditions, crop environment and nematode population parameters. Among the features and benefits of the book also figure practical management data, updated bibliographies and exhaustive illustrations.

Plant nematodes --Integrated control. --- Tree crops --Diseases and pests --Integrated control. --- Tropical crops --Diseases and pests --Integrated control. --- Tropical fruit. --- Nematodes. --- Eelworms --- Nemas --- Nemata --- Nemates --- Nematoda --- Nematoidea --- Round worms --- Roundworm --- Roundworms --- Thread worms --- Threadworms --- Subtropical fruit --- Subtropical fruits --- Tropical fruits --- Life sciences. --- Agriculture. --- Plant science. --- Botany. --- Plant pathology. --- Invertebrates. --- Life Sciences. --- Plant Pathology. --- Plant Sciences. --- Bilateria --- Worms --- Fruit --- Tropical plants --- Plant diseases. --- Botanical science --- Phytobiology --- Phytography --- Phytology --- Plant biology --- Plant science --- Biology --- Natural history --- Plants --- Farming --- Husbandry --- Industrial arts --- Life sciences --- Food supply --- Land use, Rural --- Invertebrata --- Animals --- Botany --- Communicable diseases in plants --- Crop diseases --- Crops --- Diseases of plants --- Microbial diseases in plants --- Pathological botany --- Pathology, Vegetable --- Phytopathology --- Plant pathology --- Vegetable pathology --- Agricultural pests --- Crop losses --- Diseased plants --- Phytopathogenic microorganisms --- Plant pathologists --- Plant quarantine --- Pathology --- Diseases and pests --- Diseases --- Wounds and injuries --- Floristic botany