Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Miljoenen mensen zijn afhankelijk van banaan als voornaamste voedselbron. De bananenteelt wordt echter bedreigd door verschillende omgevingsgebonden stressfactoren. De reactie van een plant op deze stressfactoren hangt af van verschillende elementen. Eén van deze elementen is de aanwezigheid en activiteit van bepaalde eiwitten. De studie van eiwitten in planten waarvan het genoom niet gekend is, gebeurt meestal met behulp van twee dimensionale gel elektroforese. Een groot nadeel van deze techniek is dat hij niet toelaat om membraaneiwitten te bestuderen. De belangrijkste redenen hiervoor zijn dat membraaneiwitten niet talrijk zijn en dat ze daarenboven niet goed oplosbaar zijn in een waterige omgeving. Aangezien deze eiwitten een belangrijke rol spelen in verschillende fysiologische reacties, was het belangrijk om technieken te evalueren en te optimaliseren om het bestuderen van membraaneiwitten in banaan toch mogelijk te maken.Aangezien slechts een heel beperkt deel van de genoomsequentie van banaan gekend is, waren technieken voor de scheiding van eiwitten een logische keuze. Peptiden die tot eenzelfde eiwit behoren, blijven tijdens de scheiding met elkaar verbonden, hetgeen eiwitidentificatie vergemakkelijkt. Bovendien is het kwantificeren van eiwitten meer vanzelfsprekend in vergelijking met het kwantificeren van peptiden. Momenteel zijn enkel gel-gebaseerde technieken voor eiwit-scheiding beschreven. Helaas zijn ze allen gelimiteerd in hun scheidingsvermogen. Hierdoor is een sterke verrijking in membraaneiwitten voor de scheiding noodzakelijk. Eerst werd gedacht aan een extractie in een mengsel van chloroform en methanol aangezien deze methode specifiek sterk hydrofobe eiwitten met korte hydrofiele gebieden zou isoleren. Naast membraaneiwitten, werden er echter ook een aantal abundante niet-membraaneiwitten teruggevonden in het chloroform/methanol extract.Daarom besloten we om bij de evaluatie van een tweede techniek, zijnde blue native elektroforese, te vertrekken van een totale membraanfractie. Deze techniek is ontwikkeld voor de studie van eiwitcomplexen. Tijdens de doctoraatsthesis werd hij geëvalueerd voor zijn capaciteit om membraaneiwitten te scheiden van de eiwitten die niet tot een complex behoren en als techniek om de interacties tussen eiwitten te bestuderen in banaan. In zijn meest algemene toepassing wordt blue native elektroforese gecombineerd met SDS-PAGE. Deze aanpak gaat echter gepaard met verlies van eiwitten bij de transfer van eiwitten van de eerste naar de tweede dimensie. Daarom werd ook getest of blue native elektroforese kan gecombineerd worden met de digestie van alle eiwitten die behoren tot één complex en een scheiding van de resulterende peptiden via chromatografie. Deze aanpak lijkt beloftevol maar vereist nog bijkomende optimalisatie. Zo werden nog steeds te veel abundante, niet-membraaneiwitten geïdentificeerd, hetgeen de identificatie van de minder abundante membraaneiwitten verhinderde.Hieruit werd besloten dat een succesvolle studie op membraaneiwitten moet starten met hetopzuiveren van een welbepaalde membraan. In dit onderzoek werd gekozen voor de plasma membraan omdat deze de scheiding vormt tussen een cel en zijn omgeving. Eiwitten die met deze membraan geasoccieerd zijn, kunnen dus een rol spelen bij het detecteren van stress in de omgeving en bij het tot stand brengen van een gepaste reactie. Aangezien de beschikbare gel-gebaseerde technieken voor membraan proteomics te beperkt bleken te zijn in hun scheidingsvermogen, werden ook gel-vrije, peptide-gebaseerde scheidingstechnieken geëvalueerd. Dit houdt in dat de eiwit-identificatie met de grootste zorg moest gebeuren. Deze identificatie was gebaseerd op het aflezen van een eiwit-sequentie van het massaspectrogram en op het visualiseren van de peptiden die aan eenzelfde eiwit zijn toegekend.Gebaseerd op al de bekomen resultaten kon uiteindelijk een efficiënte werkwijze voor het bestuderen van membraaneiwitten in planten waarvan maar zeer weinig genoom-informatie beschikbaar is, geformuleerd worden. Deze werkwijze kan nu een basis vormen voor het optimaliseren van het kwantitatieve luik van membraan proteomics.

Banane --- Bananas --- Musa --- Membrane --- membranes --- Électrophorèse --- Electrophoresis --- Stress --- Academic collection --- Theses --- Protéomique

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Banane --- Bananas --- Pratique culturale --- Cultivation --- Afrique --- Africa --- République-Unie de Tanzanie --- United Republic of Tanzania --- 634.771 --- Musa species in general --- 634.771 Musa species in general

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

FAO --- Banane --- Bananas --- Banane plantain --- Plantains --- Plante racine --- Root crops --- Pays en développement --- Developing countries --- Pool de gènes --- Gene pools --- Ressource génétique --- genetic resources --- Plante alimentaire --- Food crops --- -Root crops --- -Tuber crops --- -#ABIB:FAOdeposit --- Tuberous crops --- Root vegetables --- Banana --- Musa --- Musa sapientum --- Musaceae --- Tuber crops --- #ABIB:FAOdeposit

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

Bananier --- Banane --- Musa (bananes) --- Musa (bananas) --- Pratique culturale --- Cultivation --- Maladie des plantes --- Plant diseases --- Contrôle de maladies --- Disease control --- Durabilité --- Sustainability --- Développement socioéconomique --- socioeconomic development --- 634.771 --- Musa species in general --- 634.771 Musa species in general

Choose an application

• Reference Manager
• EndNote
• RefWorks (Direct export to RefWorks)

634.772 --- Plantains or cooking bananas --- Plant and Crop Sciences. Crops --- Fruit and Nut Crops --- Tropical Fruits --- Tropical Fruits. --- 634.772 Plantains or cooking bananas --- Plantains --- Food crops --- Tropical zones --- Cultivation --- Banane plantain --- Bananier. Culture. --- Banaanbomen. Teelt.