TY - BOOK ID - 126982174 TI - Recherche des mutations somatiques par séquençage ciblé à haut débit dans une cohorte de leucémies aiguës infantiles AU - Wawina Bokalanga, Tony AU - Antoine-Poirel, Hélène AU - Limaye, Nisha AU - UCL.. FASB - Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales PY - 2015 PB - Bruxelles: UCL. Faculté de pharmacie et des sciences biomédicales, DB - UniCat KW - Leukemia KW - Child KW - Cohort Studies UR - https://www.unicat.be/uniCat?func=search&query=sysid:126982174 AB - Infant acute leukemia (IAL) is a type of leukemia that affects children of Jess than one year of age. Despite the fact that is uncommon, the prognosis of IAL is poor compared to acute leukemia ia in older children despite the use of maximally intensified standard therapies (Chemotherapy with/without Hematopoietic stem cell transplantation).The most common genetic abnormality is KMT2A (Lysine (K)-Specific Methyltransferase 2A = MLL : Myeloïd/ Lymphoid or Mixed-Lineage Leukemia ) rearrangement.KMT2A regulates the transcription of HoxA genes involved in the regulation of cell cycle in hematopoietic cells. The fusion protein generated by KMT2A and its partner gene disrupt the regulation of HoxA genes A study during my studies, on the landscape of somatic mutations detected by Whole Genome Sequencing (WGS), Whole Exome Sequencing (WES) and targeted sequencing , described recurrent mutations in IAL. The aim of this study is to detect somatic mutations in diagnostic samples and matched relapse or complete remission samples using targeted sequencing of 8 selected genes that are most frequently mutated (FLT3, NRAS, KRAS, PIK3CA, PIK3RI, PIK3CD, TP53 and PAX5) in IAL. Despite significant technical difficulties and setbacks, we were able to analyze diagnostic samples from 6 patients, albeit with lower coverage (around I00x) than expected (2000x).We identified mutations in retain 2 candidate genes: NRAS with 2 variants (G13D et Gl2D) in a single patient, one variant present in 4 patients. Validation of the NRAS and PAX5 mutations by Sanger sequencing will be critical in validating the presence of these mutations.Targeted sequencing of ail DNA samples available will be completed pending the resolution of technical issues, to assess for recurrent mutations in diagnostic samples, as well as mutations present in minor clones of relapse. La leucémie aigüe infantile (LAI) est une forme des leucémies qui affecte les enfants de moins d'une année. Bien que très rares, le pronostic des LAis est très mauvais, comparativement aux LAs de l'enfant plus âgé, malgré une thérapie standard intensifiée au maximum (Chimiothérapie avec/sans transplantation médullaire).L'anomalie génétique la plus fréquente est le réarrangement du gène KMT2AI MLL. Le gène KMT2A régule la transcription des gènes HoxA impliqués dans le contrôle du cycle cellulaire hématopoïétique. La fusion de KMT2A avec un gène partenaire va générer une protéine de fusion qui via des cyclines recrutées va perturber la régulation des gènes HoxA. Une étude publiée au début du stage, sur le profil de mutations somatiques détectées par séquençage de tout le génome, de l'exome ainsi que le séquençage ciblé de l'ADN, nous a permis de détecter les mutations géniques récurrentes dans les LAis. L'objectif de cette étude est de rechercher par séquençage ciblé à haut débit les mutations somatiques ainsi que les mutations associées à la rechute dans 8 gènes présélectionnés et les plus fréquemment mutés (FLT3, NRAS, KRAS, PIK3 CA, PIK3Rl , PIK3CD, TP53 et PAX5) dans les LAis. Malgré les différents problèmes rencontrés au cours de l'expérience, nous avons pu analyser 6 patients avec une couverture 20 fois inférieure à celle prévue (2000x). L'analyse des différents variants génétiques nous a permis d'identifier les mutations géniques touchant 2 gènes : NRAS avec 2 variants (G 13D et G 12D) chez un seul patient et PAX5 avec un seul variant (Y370fs) présent chez 4 patients sur 6.Les deux mutations NRAS sont connues pour être somatiques et oncogéniques alors que la mutation PAX5 Y370 fs n'est pas décrite dans les cancers mais nous pensons qu'il pourrait s'agit d'un marqueur de susceptibilité aux LAis surtout qu'il est présent chez 4/6 patients. La validation par séquençage Sanger de la mutation NRAS et PAX5sur les échantillons de diagnostic et de rémission s'avère indispensable pour valider cette mutation et confirmer ou infirmer l'origine constitutionnelle respectivement. Le séquençage ciblé à haut débit pour l'ensemble des échantillons d'ADN disponibles sera fait pour évaluer les mutations récurrentes dans notre série ainsi que les mutations présentent dans les clones minoritaires de rechute ER -